本发明提供了一种代付交易方法及代付交易系统，应用于代付交易中，其中，包括，代付处理服务端接收客户端发送的交易请求并创建形成对应的交易订单，代付处理服务端每隔一预定时间周期启动一主线程，主线程创建多个与备付金账号一一对应的子线程，每个子线程获取与对应的备付金账号关联的交易订单中的交易数据；主线程根据每个子线程获取的交易数据处理形成交易处理请求并发送至第三方服务端，通过第三方服务端处理以返回处理结果至代付处理服务端；代付处理服务端根据返回结果，记录每个交易订单的交易状态，并将返回结果分别返回至对应的客户端。其避免造成请求处理进程阻塞的问题，提高了并发处理效率，节省了与交易订单对应的用户的到账时间。