本发明提供一种多区块链跨链交易处理系统，包括第一区块链系统和第二区块链系统，其中：所述第一区块链系统包括：用于接收交易的预设类型第一接口，用于向第二区块链系统发送交易验证请求的预设类型第二接口，用于接收和存储通过合法性验证的交易的交易池，及用于对交易池中的交易进行打包和共识的共识模块；所述第二区块链系统包括：用于接收和验证所述预设类型第二接口发送来的交易的交易验证模块，用于对通过所述交易验证模块的合法性验证的交易进行签名、并将签名后的交易反馈给所述交易池的验证结果反馈模块。本发明还提供一种多区块链跨链交易处理方法、区块链系统及计算机可读存储介质。利用本发明，可以实现不同种类区块链间的跨链通信。