本发明涉及微通道反应器技术领域，公开了一种用于向微通道反应器中加载微粒的系统和方法。所述系统包括输送气控制单元、微粒储罐、除尘装置、输送管道、分配器和微通道反应器；输送气控制单元用于分阶段控制进入所述微粒储罐的气体速度，使初始阶段的气流小于微粒初始流化速度，其它阶段气流不小于初始流化速度；分配器包括与输送管道连接的通道部分以及扩径部分，扩径部分的下端面与微通道反应器的上端面相配合，以使分配后的流化微粒进入微通道反应器的反应微通道中。本发明的方法结合所述系统可以均匀地将固体微粒加载到微通道反应器中的各个反应通道，避免因装填不均造成反应过程中流体分布存在偏流使反应恶化的结果。