本发明涉及一种治疗代谢综合征的中药组合物和中药提取物组合物，本发明的组合物由下列原料组成（重量比）：黄连5‑80%、枳实5‑70%、半夏0‑60%、瓜蒌0‑40%、肉桂2‑12%、红曲10‑60%。本发明中药提取物组合物由下列原料组成（重量比）：黄连提取物占2‑30%，枳实、半夏、红曲、瓜蒌、肉桂五味中药混合提取物占70‑98%。本发明组合物或中药提取物组合物中含活性成分的量为（mg/g）：总生物碱为12‑122，其中含小檗碱9‑89；总黄酮为130‑315，其中含新橙皮苷80‑186；洛伐他汀为1‑9。本发明还提供了上述组合物的制备方法及其应用。