本发明提供一种柴油机控制系统、控制方法及控制器，系统包括柴油机、异步电机、整流器、充电装置和控制器，柴油机分别与异步电机、控制器连接，整流器分别与异步电机、充电装置、控制器连接，控制器用于根据柴油机的当前转速，控制充电装置的通断。在当前转速低于第一预设转速时，控制充电装置为整流器的支撑电容充电，在支撑电容的电压值满足预设条件时，控制整流器为异步电机提供三相交流电，以使异步电机工作在电动机工况下，带动柴油机工作。上述柴油机控制系统采用异步电机，不需要专门的启动马达来带动柴油机工作，通过控制器实现对柴油机工作状态的监控，不仅节省了空间，而且实现了系统的自动控制。