本发明涉及一种区域地球化学数据校正方法，包括步骤：收集经野外地球化学采样分析所得到的分区、分幅各测量元素的分析值，并对各测量元素的分析值进行系统校正，直至绘制的地球化学等值线图中不存在等值线环绕子区边界现象为止，得到一次校正后的野外采样点数据；在已知矿化信息所在空间位置，对各测量元素赋值以形成虚拟采样点数据，以野外采样点数据和虚拟采样点数据组成的新采样点数据为基础进行二次校正，直至所有已知矿化信息所在空间位置均有相关元素的地球化学异常显示，则完成数据校正。本发明方法在传统校正方法的基础上进行了二次校正，使已知矿化信息均落在相关元素异常之上，解决了已知矿化信息与相关地球化学元素异常信息局部不匹配的问题。