本申请实施例提供一种消化道共聚焦激光显微内镜病变图像识别方法及装置，通过从消化道共聚焦激光显微内镜采集到的医学影像中的单位时间视频流中获取第一数量帧关键帧，并对第一数量帧关键帧进行过滤，得到过滤后的第二数量帧关键帧，然后基于预先训练的病变图像识别模型对第二数量帧关键帧中的每帧关键帧中的病变部位进行预测，获得每帧关键帧的预测结果，若相同的预测结果超过第二数量，则输出对应的病变图像识别结果。由此，通过对共聚焦图像深度学习分析从而对共聚焦图像中的病变情况进行识别，辅助内镜医师完成消化道共聚焦激光显微内镜检查工作，减少因检查医生经验不足带来的误诊，有效降低患者的经济及健康损失。