本发明提供的一种基于分布式系统的版本自动部署方法及系统，包括：获取应用程序版本配置文件、批量调度文件及初始信息；所述批量调度文件包括：各作业节点号、各作业节点状态及各节点脚本名称；根据所述初始信息及所述应用程序版本配置文件对所述批量调度文件进行初始化，并生成各节点脚本名称对应的节点脚本；根据多个所述作业节点号的作业节点状态，迭代执行多个作业节点号分别对应的节点脚本进行版本部署。本申请通过批量调度文件及节点脚本对分布式系统的版本自动部署(包括程序升级和程序回滚)，具有节约人力成本、提高作业效率降低操作失误风险的有益效果。