本发明针对卫星高空间分辨率NDVI数据稀疏、数据时间上不连续、NDVI噪声的技术问题，公开了一种融合生成高空间和高时间分辨率NDVI长时间序列的方法。本发明在初始融合NDVI时间序列数据的基础上，对于需要再融合处理的目标时间点，基于同天不同年的初始融合NDVI图像、高时间低空间图像，以及目标时间所在年对应时间的高时间低空间图像进行第二次时空融合处理，得到各年份的第二融合NDVI图像，再基于所设置的不同年份的权重对第二融合NDVI图像进行加权处理，得到各目标时间点重建数据，即最终融合结果，达到空间和时间信息最大化地相互补充和利用，提高数据重建的效果，提升所生成的融合数据在精度和稳定性。