本发明公开了一种电磁场辐射抗扰度视频自动检测系统及检测方法，包括：用于判定电磁场辐射抗扰度的重点观测区域的敏感区判定模块；用于处理不足以进行分析的敏感区域图片的数字图像处理模块；用于实现测试时间的计算功能的计算模块；用于拆分分析视频的视频拆分模块；用于结果比对和分析处理的数据处理模块；用于数据存储或传输的数据存储模块，检测方法包括：消除电磁干扰，获取试验视频，判定敏感区和视频分析。本发明降低了图像分析的任务量，提高效率，系统可提高电磁兼容辐射抗扰度检定速率，提升数据可靠性，确保图像的清晰度和完整度，系统可提高电磁兼容辐射抗扰度检定正确率。