本发明提供了一种药瓶摇晃设备，其包括药瓶夹具及夹具摇晃机构；药瓶夹具包括支座、夹持机构、直线滑轨及夹具固定盖，夹具摇晃机构包括第二驱动电机、旋转盘及凸起件；夹持机构夹持药瓶，支座的底部上沿着左右两侧方向设有直线滑轨，夹具固定盖盖设于支座上，并且卡住支座的左右两侧；旋转盘的盘心设置于第二驱动电机的驱动轴上，凸起件固定设置于旋转盘的外围位置处，凸起件可滑动地设置于直线滑轨内；第二驱动电机驱动旋转盘以盘心为轴进行自旋，旋转盘带动凸起件以盘心为圆心做圆周运动，凸起件在直线滑轨内滑动，以使夹持机构在夹具固定盖内沿着支座的前后方向移动。本发明可方便、快速且稳定地夹持并摇晃药瓶，可实现药瓶摇晃自动化流程。