本发明提供一种IT系统运维监控数据的辅助预处理方法和系统，基于Hadoop采集运维监控数据，将运维监控数据以文件形式进行存储，得到原文件数据；判断原文件数据的各条数据条目的长度是否一致，若长度一致，则将所述数据条目定义为协议类数据；若长度不一致，则将所述数据条目定义为日志类数据；对协议类数据、日志类数据分别进行预处理，得到预处理结果数据；展示预处理结果数据、原文件数据，供运维人员按需调整。可适用于各类IT系统运维监控数据，减少运维人员在对数据进行人工解析过程中对专家的依赖度；易于实现，复杂度不高，且随着数据样本数的增多能够不断获得更精确的预处理结果，以辅助运维人员做进一步的数据处理。