本发明公开一种电源转换电路及其运作方法。电源转换电路包括误差放大电路、第一比较单元、第二比较单元及控制单元。误差放大电路具有第一操作模式与第二操作模式并提供输出信号。第一比较单元耦接误差放大电路并接收输出信号及斜波信号以产生第一比较信号。第二比较单元接收输出电压及第一参考电压并提供第二比较信号。控制单元耦接误差放大电路、第一比较单元及第二比较单元并根据第一比较信号、第二比较信号及致能信号提供控制信号控制误差放大电路的操作模式。当误差放大电路于第一操作模式时，输出信号为误差放大信号，当误差放大电路于第二操作模式时，输出信号为第二参考电压。本发明可有效避免电源转换电路刚从不连续导通模式切换至连续导通模式时由于输出信号较低而导致输出电压往下掉，以维持稳定的输出。