本发明属于分子力场技术领域，具体涉及一种分子力场参数生成的计算任务管理分析系统及其运行方法，包括计算结果分析模块和计算任务管理模块，计算结果分析模块与计算任务管理模块连接，计算任务管理模块通过云计算接口与力场构建计算服务器连接。运行方法为（1）选择分子力场构建计算模板，（2）选择计算任务提交平台并提交计算，（3）回收计算结果，（4）分析计算结果。本发明以科研人员为主的力场构建系统使用者通常不具备强大的开放接口开发能力，提供了方便的云计算调用接口，提高力场构建的速度；全景化且直观；提供对力场构建计算结果的交互式分析方式，方便快速定位计算异常，且能支持自动化处理分析任务。