一种用于霉菌的虹吸导管补料摇床培养方法，该方法是以补料摇床为基础，增设功能性虹吸导管固体培养连接器使多只摇瓶串连，从第一只培养瓶加入目标菌株开始，由虹吸导管连通构成固液交替发酵至最后一只摇瓶结束，进而获得有目的的快速多次培养。本发明的方法可用于驯化分离高活性果胶酶黑曲霉菌以及白僵菌菌种的复壮，其中功能性虹吸导管所用的材料、管径大小、导管的长度、导管内载体成分配制等对目标菌株培养有关键性影响，因此虹吸导管可根据不同使用专一设计；本发明利用补料摇床为微生物菌株驯化、分离与复壮提供新的技术手段，适合广泛应用于食品、医药、饲料和生物制品等领域。