本发明公开了一种总线处理效率评估方法、系统和计算机存储介质，该方法包括：对各医疗业务节点之间的消息交互进行实时监测，以获取总线的基础指标和预设时间间隔内每一消息的处理时间指标及业务处理流程数；根据处理时间指标按照预设处理规则计算平均消息处理时间；根据业务处理流程数按照预设业务处理流程算法计算各消息的平均业务处理流程数。根据本发明的技术方案，通过对总线在处理消息过程中的相关指标进行实时监测，同时考虑到总线接口的并发度及消息业务处理流程对处理效率的影响，利用这些指标可有效地对该总线的处理效率进行综合评估，进而可为医疗业务消息总线的优化提供有效参考等。