本发明涉及生物油加氢处理领域，特别是从低价值生物油生产可再生基础油和柴油的方法。发现通过首先从原料中分离出饱和游离脂肪酸的至少一部分，然后将这一饱和游离酸进料单独在酮化反应中进行处理，随后进行加氢脱氧和加氢异构化反应，产生可再生基础油流，可以以高效的方式将含有游离脂肪酸和脂肪酸酯的低价值生物油加工成可再生基础油和可再生柴油。可以在单独的加氢脱氧和加氢异构化步骤中加工剩余的游离脂肪酸耗尽的进料，以产生可再生柴油流。将原料拆分成两个单独的流，其中一个是饱和游离脂肪酸流，与整个原料的合并处理相比，提供了令人惊讶的优势。