本发明公开了一种数控机床自诊断方法及系统，涉及机床加工，包括在误差超出标准时，先运行软件自检测，包括以相同流程及参数进行系统仿真运行，测试总误差是否符合标准，以及将加工流程分解，通过系统仿真每个步骤，测试步骤误差是否符合标准；在软件自检测通过后，进行实际加工检测，包括以相同流程及参数进行实际加工，在加工过程中检测每个加工步骤完成后的误差，并分别与每个步骤的标准误差比较，以及分解出前后两个加工步骤，分别进行加工，检测总误差与该加工过程的标准误差比较。先对软件进行检测，确定误差出现的具体步骤。在软件自检过后才进行实际的加工检测，提高检测效率。整个方案可较为直观的确定误差产生的具体步骤，方便检修。