本发明公开了一种用于双层安全壳核电站的基础隔震与三维减震结构，包括内安全壳、外安全壳、堆芯支撑结构、堆芯结构、水平隔震支座、位移转向装置、竖向隔震支座、竖向阻尼器，外安全壳与地面固定连接，内安全壳与地基通过水平隔震支座连接，堆芯结构的承重构件与内安全壳的底板通过竖向隔震支座连接，堆芯结构的承重构件与内安全壳的侧壁通过竖向阻尼器连接，内安全壳与外安全壳之间通过位移转向装置连接。根据本发明的用于双层安全壳核电站的基础隔震与三维减震结构，通过设置水平隔震支座和位移转向装置、竖向隔震支座和竖向阻尼器的综合作用，产生三维的减震效果，可以满足核电站特殊抗震安全要求，显著地提高了核电站结构的抗震安全性。