本发明公开了一种分布式海洋在线监测数据的实时聚合系统及聚合方法，该系统包括数据注册器、数据聚合服务和数据集成器三部分，所述数据注册器和数据聚合服务分布于每一个海洋监测数据接收终端服务器上，通过数据注册器对各海洋监测数据接收终端服务器的异构数据资源进行整合，并建立数据聚合服务实现数据的跨平台跨系统发布，数据集成器根据需要集成一个或多个数据聚合服务，对数据进行按需存储和显示。本发明所公开的系统及方法解决了目前的海洋监测岸站系统数据接收地理位置分散、数据结构各异，数据集中接收、集中显示困难的问题，可以实现实时的数据聚合，实现数据的跨平台显示，具有很好的应用前景。