本申请提出一种文件管理方法、装置及系统，该方法可应用于文件服务器，所述文件服务器按照设定周期生成新增文件的索引，并将生成的索引发送给应用服务器；其中，所述索引中携带唯一标识所述文件服务器的令牌；所述方法包括：查询应用服务器内是否具有与所述文件服务器对应的查询标记；其中，与所述文件服务器对应的查询标记，为表示需要所述文件服务器查询并反馈设定的文件的标记信息；如果接收到应用服务器发送的查询标记，则检索得到与所述查询标记对应的文件并发送给所述应用服务器。上述处理过程可以使应用服务器将文件查询请求精准地发送至存储待查询文件的文件服务器，可以使应用服务器文件查询时网络和内存资源得到合理利用，避免了资源浪费。