本发明涉及一种闭式循环径流涡轮发电系统磁悬浮转子结构及其制造工艺。转子由锁紧螺母、压气机叶轮、轴径向复合轴套、连接轴套、电机轴、径向轴套和涡轮转轴装配而成。在完成转子组成零部件加工的基础上，首先进行电机轴的装配，其次进行电机轴、径向轴套与涡轮转轴的装配，然后进行连接轴套与电机轴的装配以及轴径向复合轴套与连接轴套的装配，最后进行压气机叶轮、连接轴套、涡轮转轴和锁紧螺母之间的装配，形成完整的转子结构。该转子采用磁悬浮轴承，避免了涡轮发电系统工作时转子与轴承之间的接触，增强了转子在不同工况的运转稳定性，能够显著提高转子的结构可靠性与工作效率，同时还能够有效降低闭式循环径流涡轮发电系统的工作噪音。