本发明一种基于载波分裂的卫星通信抗干扰方法，地面终端将用户通信载波分裂成若干个子载波，星载干扰检测设备获知信道状态后通过星地链路的交互，对地面终端进行频谱资源管理，地面终端进行子载波交换，规避受干扰的频段，星载转发器接收信号后再进行相应的逆交换与干扰抑制达到抗干扰通信的目的，且不需要受传输体制的限制。本发明提出的基于载波分裂的卫星通信抗干扰方法，通过载波分裂与子载波交换、逆交换与干扰抑制实现抗干扰通信，能够不受通信体制的限制；本发明提出的方法可以有效的改善卫星移动通信系统中受干扰用户的通信质量，提高资源利用率，具有较大的使用价值。