一种异形玻璃自动钻孔装置的操作方法，玻璃经机械手输送至旋转台上方，旋转台提前旋转到需要钻孔位置的角度吸附固定，C形架快速运动到需要钻孔的位置，定位完成后，一对夹紧回水收料机构夹紧玻璃，下钻孔机构和上钻孔机构依次对玻璃进行钻孔，完成钻孔过程，夹紧回水收料机构将冷却水和废料集中回收，夹紧回水收料机构松开玻璃，C形架回到待机位，旋转台旋转到接玻璃的角度，机械手吸盘将玻璃吸起，玻璃完成钻孔，机械手将玻璃输送到下一工位；本发明能够实现各种形状的玻璃的钻孔，自动识别孔的大小和位置，自动定位，不伤玻璃表面，不需要二次定位，钻孔质量好，效率高，钻头自动修整和长度补偿，废水、废料自动回收，操作简单方便。