一种基于双向快速索引的多级临床基因组变异数据存储方法
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摘要
本发明公开了一种基于双向快速索引的多级临床基因组变异数据存储方法，包括：一级存储，建立文件索引数据表，依据所述文件索引数据表存储原始的VCF文件；二级存储，依据原始的VCF文件结构和所述文件索引数据表中的上下文信息，将原始的VCF文件转换并存储为数据库表；三级存储，建立患者‑变异双向索引机制，其中第一索引以患者为主键，每个患者主键对应一个变异长二进制数用于索引所有已定义的变异，第二索引以变异为主键，每个变异主键对应一个患者长二进制数用于索引所有的患者，依据所述患者‑变异双向索引机制进行数据存储。本发明可快速获取所需的患者信息和变异信息，显著提高信息检索效率。
基本信息
专利标题 ：
一种基于双向快速索引的多级临床基因组变异数据存储方法
专利标题（英）：
暂无
公开（公告）号 ：
CN110718277A
申请号 ：
CN201910823376.5
公开（公告）日 ：
2020-01-21
申请日 ：
2019-09-02
授权号 ：
CN110718277B
授权日 ：
2022-06-14
发明人 ：
李昊旻段会龙舒强董聪吴鼎文
申请人 ：
浙江大学
申请人地址 ：
浙江省杭州市西湖区余杭塘路866号
代理机构 ：
杭州天勤知识产权代理有限公司
代理人 ：
胡红娟
优先权 ：
CN201910823376.5
主分类号 ：
G16H10/60
IPC分类号 ：
G16H10/60 G06F16/22
IPC结构图谱
G
G部——物理
G16
特别适用于特定应用领域的信息通信技术
G16H
医疗保健信息学，即专门用于处置或处理医疗或健康数据的信息和通信技术
G16H10/00
专门用于加工或处理患者相关医疗或保健数据的ICT
G16H10/60
患者特定数据，例如电子病历记录
法律状态
2022-06-14 ：
授权
2020-02-21 ：
实质审查的生效
IPC(主分类) : G16H 10/60
申请日 : 20190902
申请日 : 20190902
2020-01-21 ：
公开
注：本法律状态信息仅供参考，即时准确的法律状态信息须到国家知识产权局办理专利登记簿副本。
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