一种颌位性凹面畸形矫治系统及其设计方法，其中矫治系统包括一具有壳状本体的上颌壳状牙科器械，壳状本体对应的后牙区位置处向对颌方向凸出设置凸起部，壳状本体唇侧面设有牵引部，壳状本体对应的后牙区设有与固位附件扣合的固位部；凸起部与下颌后牙区配合进行咬合重建，使下颌切牙与上颌切牙趋于对齐；牵引部配合上颌颌外反向牵引，使颌骨矫形重塑；固位部与固位附件卡扣防止上颌壳状牙科器械从其配合的牙齿上脱落。设计方法为上述颌位性凹面畸形矫治系统的设计方法，能够设计出具有治疗针对性的矫治系统，实现颌位性凹面畸形的治疗。