本发明实施例提供了一种电梯安全运行方法、系统、设备、计算机可读存储介质及安全功能装置，在所述电梯安全运行方法应用于电梯主控制器时，所述方法包括：检测第一门区信号和第二门区信号；在检测到所述第一门区信号和第二门区信号均为门区有效信号时，根据所述门区有效信号和电梯运行状态生成封门开关组闭合指令，并将所述封门开关组闭合指令发送至安全功能装置，以使所述安全功能装置控制封门开关组短接门锁回路；在接收到来自所述安全功能装置的封门反馈信号时，执行提前开门或再平层操作。本发明实施例可大大降低封门开关的动作次数，提高了相关硬件的使用寿命。