本发明属于自动控制技术领域，公开了智能花箱控制系统及方法。该系统包括：控制终端与多个智能花箱，各个智能花箱分别包括种植区与储水区，种植区内设有土壤湿度传感器及导管，储水区内设有水泵，水泵与种植区通过导管连接，土壤湿度传感器实时采集所述种植区内的土壤湿度，将采集到的土壤湿度发送至控制终端，控制终端接收土壤湿度传感器发送的土壤湿度，将预设湿度阈值与土壤湿度进行比较，在土壤湿度小于预设阈值时，生成灌溉指令，并将灌溉指令发送至水泵，水泵接收所述控制终端发送的灌溉指令，并根据灌溉指令将储水区内的水输送至种植区，以使种植区内的土壤湿度满足预设湿度阈值，提高了智能花箱自动控制的智能性、准确性与及时性。