本申请涉及区块链技术领域，具体涉及一种区块链链上数据结构化存储方法及系统。本方法包括以下步骤：数据探测模块根据最大区块高度、当前处理高度以及区块高度标志位从区块链上获取一个区块，设置区块的对应高度的第一标志位，并将区块发送给数据过滤模块；数据过滤模块将需要的交易记录解析为结构化数据，并发送给数据存储模块；数据存储模块将结构化数据进行存储；数据探测模块设置区块的对应高度的第二标志位同时对当前处理高度执行加一操作；重复执行上述步骤，实现区块链上所有区块数据的结构化存储。本方法既能实时完整地获取区块链上的数据，同时支持多种不同格式数据的结构化转换，提供可灵活扩展数据存储方式和高效的数据查询方式。