一种LNG双枪加气机的加气控制系统及控制方法，包括两个加气系统，两个加气系统分别包括加气枪、液相管路、回气枪、大循环管路、小循环管路、电子计控器，液相管路上设有液相阀、液相流量计，加气枪连接液相阀下游端，液相流量计的上游端并联于进液口，大循环管路的上游端为空闲加气枪插口，小循环管路上游端设有气相流量计连接回气枪，下游端连接大循环管路，大循环管路下游端并联于回气口，各液相管路位于液相流量计的上游通过回气阀与大循环管路连接，电子计控器分别与所对应的液相流量计、气相流量计、回气阀和液相阀电连接，两个电子计控器之间通过通讯线进行信号传输，通过本发明的控制方法对两个加气系统的运行状态进行交互控制。