本发明公开了一种用于煤矸石人工生态基质的复合微生物菌剂，包括5种放线菌：高温紫链霉菌(Streptomyces thermoviolaceus)，嗜热淀粉酶链霉菌(Streptomyces thermodiastaticus)，嗜热一氧化碳链霉菌(Streptomyces thermocarboxydus)，微白黄链霉菌(Streptomyces albidoflavus)和热普通链霉菌(Streptomyces thermovulgaris)，1种细菌：假单胞菌(Pseudomonas sp.)，以及1种霉菌：草酸青霉菌(Penicillium oxalicum)。该菌剂的制备过程包括：菌种活化、种子液制备、液态复合菌剂制备、固态菌剂制备4个步骤。本发明技术解决了煤矸石中微生物缺少，养分不利于植物吸收利用的问题，为煤矸石及园林绿化废弃物的资源化利用提供了一条新途径，在煤矸石的处理及资源化利用等方面具有广阔的应用前景。