本发明提出了一种无人机水体采样设备，包括无人机以及固定在无人机底部的采样机构，所述无人机包括主控制模块、信号传输模块、信息采集模块、定位模块以及供电模块，所述主控制模块用于控制无人机以及采样机构的执行动作，所述信号传输模块用于接收操作命令信号，所述信息采集模块用于摄影、摄像对指定水域的环境进行记录，所述定位模块用于定位无人机的位置，所述采样机构包括与无人机相固定的固定盖、与固定盖相连的壳体以及设在壳体内的采水器。无人机搭载采样设备，可用于开阔水域、地形险峻区域、存在未知重污染危险，人员船只难以进入的地区的水体采样，可以减小作业风险，使得作业任务变的安全简易。