本发明公开了一种纳米负载钛系复合催化剂的制备方法，将钛系化合物、正硅酸乙酯与水解剂溶于无水乙醇中，室温下搅拌反应一定时间，得到混合溶液；往所述混合溶液中加入选自Mg、Al、Mn、Co、Zn的氯化物、醋酸盐或磷酸盐的一种或几种金属盐，继续搅拌，升温挥发掉多余溶剂后即可得到凝胶；所述凝胶在超临界介质的存在下进行超临界干燥，得到最终的纳米负载钛系复合催化剂。本发明制得的催化剂抗水解能力强，可长期保存，活性稳定；催化活性高，稳定性好，能有效提高酯化和缩聚反应效率，反应过程中性能稳定，所得产品指标稳定；该催化剂不含重金属，减少对环境和人类的危害；使用该催化剂制备的聚酯，色相好、黄色指数小、性能稳定。