本申请公开了一种用于机器视觉质量检测设备的自适应剔废控制方法及系统，所述方法包括：标定待测物在第一传送带上的第一起始位置；根据第一传送带的速度与第一起始位置跟踪待测物的第一实时位置；当第一实时位置到达与第一传送带接续连接的第二传送带时，重新标定待测物在第二传送带上的第二起始位置；根据第二传送带的速度与第二起始位置跟踪纸张的第二实时位置；根据第二实时位置对待测物进行自适应剔废。本申请重新标定待测物在第二传送带的位置，消除了分段皮带速度差、皮带交接处传送误差的影响，在更改传送带速度或更换产品时，不需要调整位置参数就能准确定位，实现了不同速度、不同产品准确定位的目的。