本发明提供一种基于气液动力学电池模型在线估算开路电压的方法及系统，包括以下步骤：通过气液动力学开路电压电池模型估算电池第一开路电压；依据第一开路电压查“开路电压‑容量”表得到第一容量；以第一容量为初值，利用微步长安时积分法得到第二容量；依据第二容量查“容量‑开路电压”表得到第二开路电压；通过气液动力学端电压电池模型估算电池端电压；计算气液动力学开路电压电池模型的扩展卡尔曼滤波算法的系数矩阵和协方差矩阵；更新气液动力学开路电压电池模型的扩展卡尔曼滤波算法的系数矩阵和协方差矩阵，然后循环，完成模型参数在线辨识和电池开路电压在线估算。本发明在估算电池开路电压之前无需对模型参数和初值进行辨识或识别。