本实用新型公开了一种吻合器用装钉系统，包括：待料区域，包括用于装配空钉仓的钉仓工装，钉仓工装设置在装载托盘上，通过气动推送装置推送至装钉区域内的预装载位置；装钉区域，包括送钉装置和装钉机械手，送钉装置将需要装载的钛钉输送至设定位置，然后通过装钉机械手夹取钛钉送入钉仓工装上的空钉仓内；成品区域，装满料的钉仓工装随着装载托盘滑移至成品区域，通过气动推送装置推送至成品托盘中，随后下一轮装钉开始运行。通过上述方式，本实用新型吻合器用装钉系统装钉速度快，装钉动作具有高重复性和高一致性，大大加快装钉周期，提高吻合器产能效率，装钉过程有序进行，实时监控钛钉姿态，避免漏钉及不良钉的出现，保证装钉质量稳定。