本实用新型公开了一种吻合器钉仓治具，包括：治具主体，治具主体包括呈条块状的基座，基座表面呈开放式设置，基座两侧分别具有第一侧压板和第二侧压板，钉仓布置在基座表面通过第一侧压板和第二侧压板使钉仓保持水平，沿着基座长度方向的中心位置具有安装条，通过安装条使得钉仓能够直接卡装在治具主体的表面。通过上述方式，本实用新型吻合器钉仓治具开放式设计，钉仓直接放入简单易用，能够保证钉仓放置的精准性，提高了装钉的精准性，便于操作者对钉仓进行快速取放，提高了钉仓的拆装效率。