本实用新型提供一种船舶发动机废气脱硫装置，利用海水或淡水+碱性物质作吸收剂且采用初洗器+主塔相结合二级脱硫技术废水经处理可直接排入海洋，包括烟气系统、脱硫系统、海水供给系统、废水处理系统及控制系统，所述烟气系统包括增压风机和连接管道，由发动机烟囱出口经过增压风机增压后进入脱硫塔，所述脱硫系统包括脱硫塔、循环泵、流量计、循环水池，所述海水供给系统包括过滤器、海水检测仪一、海水泵，所述废水处理系统包括置换泵、曝气池、曝气风机、外排泵、转筒真空过滤机、污泥池、海水检测仪二。本实用新型实现了“双模式+二级脱硫”的结合，工艺流程简单、系统可调性强、运行成本低，适用于船舶发动机废气脱硫。