本实用新型公开了一种荧光信号采集装置及包括其的荧光信号采集系统，用于采集样品膜上的荧光信号，其包括：激发光光源，用于激发样品膜产生荧光信号；壳体，其内设有样品膜；感光元件，其设于壳体的内部，用于接收荧光信号并转换为电信号；滤光元件，其设于样品膜的上方和/或样品膜的下方，且位于感光元件的上方，用于过滤激发光光源发出的样品膜表面的干扰光和感光元件表面的干扰光。本实用新型提供的荧光信号采集装置及包括其的荧光信号采集系统通过采用接触式成像中样品膜与感光元件的近距离设置的方式获取样品膜上的荧光信号，可以减少荧光信号损失，提高信号锐度，使输出的信号更加准确，提高了实验效率，极具应用价值。