本实用新型涉及一种二沉池水面水藻自动清除系统，包括由电机驱动的旋转柱，其特征在于：在所述旋转柱的左右两端对称设置有随旋转柱旋转的工作臂，在一端的工作臂上安装有除藻机构，在另一端的工作臂上安装有配重块；还包括除藻井，在二沉池内沿池内壁设置有除藻井，该除藻井由井体、阀门、篦板及导向板构成，在井体的左右两侧设置有导向板，在井体的井壁上端设置一进水口，在进水口处设置有阀门，在井壁的下端设置有排废口，在井体的上端井口处设有一篦板。本实用新型结构设计科学合理，具有省人省力、提高清理效率、安全可靠、易于实现的优点，是一种具有较高创新性的二沉池水面水藻自动清除系统。