本实用新型公开了一种医疗废水高效处理装置，包括箱体，箱体分成连通的消毒室和缓冲室，消毒室上方设有电机和减速箱，消毒室内设有搅拌轴和旋流混合器，电机安装在减速箱顶部，减速箱的输出端与搅拌轴连接，搅拌轴末端设有旋流混合器，消毒室底部设有导流斜板和排泥口，消毒室通过抽水泵和进水管与废水箱连通，抽水泵与消毒室之间设有螺旋管道，进水管上连有加药盒体，加药盒体伸入进水管一端为注射喷嘴，注射喷嘴的侧壁设置有若干位于进水管中心轴线处的喷孔。采用本装置先在管道内进行涡流式化学消毒，后在消毒室旋流式物理消毒及沉淀过滤一体化操作，不仅能够对医疗废水进行高效彻底消毒，且占地小，便于移动，适合小型门诊使用。