本实用新型提供了一种基于经颅磁刺激治疗仪的高效升压装置，包括依次连接的电源、储能组件及控制组件，所述高效升压装置还包括夹设于所述电源和所述储能组件之间的升压组件，所述升压组件包括依次连接的PWM芯片、IGBT模块、变压器及滤波器，所述电源、所述升压组件、所述储能组件及所述控制组件依次连接形成电流通路。与相关技术相比，本实用新型提供的高效升压装置采用PWM脉冲开关的方式升压，使得所述经颅磁刺激治疗仪具有体积小、电转换效率高且轻便的优点。