本实用新型涉及一种经颅磁刺激器的线圈冷却装置，其包括冷却槽主体、第一盖体、第二盖体、冷却液进口、冷却液出口、进液接头和出液接头；所述第一盖体和第二盖体分别位于所述冷却槽主体两侧并分别与冷却槽主体密闭连接；所述冷却槽主体与所述第一盖体之间具有磁刺激线圈容纳腔；所述第一盖体朝向冷却槽主体的表面和所述冷却槽主体中间部分分别设置有冷却液第一导流结构和第二导流结构；所述冷却液进口和冷却液出口与至少一个所述导流结构连接；所述进液接头与所述冷却液进口连接，所述出液接头与所述冷却液出口连接。本实用新型提供的线圈冷却装置可对磁刺激线圈进行双面循环液冷，散热效果好，同时具有安全性高、无漏电隐患的优点。