本实用新型的目的在于提供一种细长医用塑胶管自动钻孔机。该细长医用塑胶管自动钻孔机，由机座部件、上框部件、管子导入部件、管子定位夹紧部件、钻孔部件及电气控制系统组成，上框部件、管子导入部件、管子定位夹紧部件、钻孔部件安装在机座部件上，电气控制系统安装在机座部件、上框部件上。将细长医用塑胶管从管子导入部件导入，然后，由管子定位夹紧部件将细长医用塑胶管定位夹紧，然后，钻孔部件对细长医用塑胶管进行钻孔加工作业，然后，在钻孔作业完毕后，管子定位夹紧部件松开被夹紧的细长医用塑胶管，然后，取出钻孔作业完毕的细长医用塑胶管。整个钻孔加工过程速度快、效率高、加工质量好，非常适用于医疗设备生产厂家。