本实用新型公开了一种涉及菌种接菌技术领域的智能净化接菌机，包括机箱，机箱中设有水平设置的分隔板，分隔板将机箱分隔为独立的臭氧发生腔体和加热腔体，臭氧发生腔体的一侧设有臭氧发生腔体盖板，臭氧发生腔体的相对于臭氧发生腔体盖板的另一侧设有固定箱板，臭氧发生腔体中安装有若干组臭氧灭活装置，加热腔体内设有热风杀菌装置，机箱中设有对臭氧灭活装置及热风杀菌装置进行控制调节的控制组件，综合利用臭氧和高温气流对接菌机背板外的局部空间进行双重杀菌，便于在该空间内进行接菌作业，有效提升接菌作业成果，设备杀菌效率高、不使用有害化学药剂，且整体结构简单、造价低廉，便于农业接菌生产的使用和快速普及。