本实用新型涉及电源领域，尤其涉及超级电容储能系统及基于超级电容储能系统电源管理系统，包括若干个串联连接的超级电容器单元，该系统还包括：连接在电源输出端的恒流限压充电电路；若干个分别与各超级电容器单元连接的输入电压均衡电路，所述输入电压均衡电路的输入端连接恒流限压充电电路的输出端；以及一端与各超级电容器单元输出端连接，另一端与负载连接的的动态柔性输出电路。本实用新型在原有串联超级电容器单元的基础增加恒流限压充电电路、输入电压均衡电路、动态柔性输出电路以及过压保护电路，以实现对各超级电容器单元进行恒流恒压充电、各超级电容器单元两端的电压达到均衡、动态柔性均压输出以及过压保护。