本实用新型涉及一种多功能分子生物学电泳辅助装置，包括外框体，外框体内底部设置有向上凸出的透明放置台，放置台上放置电泳槽，外框体上设置有用于固定电泳槽的限位装置，放置台底部设置有底槽，底槽内设置有紫外线光源，电泳槽两端电极连接有伸出外框体外的电连接装置，外框体侧壁上设置有真空泵，真空泵进气端与外框体内腔相连通，真空泵出气端位于外框体外侧，外框体上端设置有透明的封盖，封盖底部四周设置有与外框体上端相匹配的密封槽，外框体上端卡设在密封槽内。