本实用新型公开了一种清洗枸杞籽的分离设备，包括底座和第二转轴，所述底座的一端上方固定连接有支架，且支架的上表面安装有电机，所述电机的一侧安装有传动机构，且传动机构的一侧设置有分离机构，所述分离机构的一侧安装有粉碎室，且粉碎室的外上壁固定连接有进料口，所述粉碎室的内部安装有水泵。该清洗枸杞籽的分离设备设置有滤膜，水泵将枸杞汁和枸杞籽的混合液从粉碎室通过抽汁管抽入过滤腔内，经过滤膜的过滤吸附，使枸杞汁和枸杞籽相互分离，以达到汁籽分离的目的，第一转轴带动搅拌杆搅动枸杞汁，减少沉淀，使得到的枸杞汁更加浓郁，保障其原汁原味，提高枸杞汁的出汁质量。