本实用新型公开了一种载玻片自动清洗装置，包括清洁箱和载玻片架，所述清洁箱内轴接有至少三个旋转柱，旋转柱间通过传动带相连，其中一个旋转柱上安装有横向齿轮，横向齿轮处于传动带上方；横向齿轮啮合有竖向齿轮，竖向齿轮连接有旋转装置；所述传动带通过竖条连接有固定块，固定块外固定有弹性层；沿传动带转动方向依次安装有清洁液喷管、清水喷管和热气喷管；清洁液喷管、清水喷管和热气喷管上均安装两排喷嘴；两排喷嘴一排向传动带旋转方向倾斜设置，另一排向传动带旋转方向的反向倾斜设置。本实用新型结构简单，使用方便，可以批量的清洁和烘干载玻片，大大提高了载玻片的清洁效率，节约了人工。