本实用新型提供了一种手持式香菇菌棒注水器，包括位于注水器中心轴线位置的撑杆和均匀设置在撑杆两侧的套管，所述套管内设置有注水针，所述注水针通过电动伸缩管连通供水软管，所述套管接近香菇菌棒的一侧固定连接有凹状环形的中空顶托，所述撑杆上远离套管的一端活动设置有与顶托配合固定香菇菌棒的底托，所述撑杆上固定有控制开关和电源组件。本实用新型设计简单合理，能同时对两根香菇菌棒进行注水操作，实现电动推针，操作简便省力，大大减小了工作人员的工作强度并提高了注水效率。